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DARNED數(shù)據(jù)庫(kù)收錄了human等多個(gè)物種的RNA編輯位點(diǎn)信息，除了最常見(jiàn)的A->I類(lèi)型的RNA編輯外，還收錄了部分C->U的RNA編輯位點(diǎn)，網(wǎng)址如下

https://darned.ucc.ie/

該數(shù)據(jù)庫(kù)包含的物種如下

1. Human

2. Mouse

3. Drosophila

官網(wǎng)提供了三種檢索方式

1. region-based

Assembly選擇對(duì)應(yīng)的物種，然后根據(jù)Chromosome, start, end篩選對(duì)應(yīng)的染色體區(qū)域上的RNA編輯位點(diǎn)信息，通過(guò)Limit，可以篩選特定基因區(qū)域，比如exon上的編輯位點(diǎn)信息，搜索框如下

2. gene-based

gene-based支持直接檢索某個(gè)基因上的RNA編輯位點(diǎn)信息，搜索框如下

3. sequence-based

sequence-based支持直接輸入一段序列，首先確定該序列在基因上的位置，然后給出對(duì)應(yīng)區(qū)間的RNA編輯位點(diǎn)信息，搜索框如下

以human基因AHR為例，檢索結(jié)果如下

在檢索結(jié)果中，會(huì)給出每個(gè)RNA編輯位點(diǎn)的類(lèi)型，染色體位置，對(duì)應(yīng)的基因，SNP, 是否位于Alu重復(fù)序列上等信息。

該數(shù)據(jù)庫(kù)是免費(fèi)下載的，可以從以下鏈接下載到各個(gè)物種的RNA編輯位點(diǎn)信息

https://darned.ucc.ie/download/

相比RADATR數(shù)據(jù)庫(kù)，該數(shù)據(jù)庫(kù)中收錄的RNA編輯位點(diǎn)數(shù)量會(huì)少一些。

感謝各位的閱讀！關(guān)于“DARNED數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用”這篇文章就分享到這里了，希望以上內(nèi)容可以對(duì)大家有一定的幫助，讓大家可以學(xué)到更多知識(shí)，如果覺(jué)得文章不錯(cuò)，可以把它分享出去讓更多的人看到吧！

本文題目：DARNED數(shù)據(jù)庫(kù)有什么用
標(biāo)題路徑：http://www.rwnh.cn/article48/jddjep.html

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