WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決

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“老米”投稿：手把手10分文章WGCNA復(fù)現(xiàn)：小膠質(zhì)細(xì)胞亞群在腦發(fā)育時(shí)髓鞘形成的作用 , 里面是有TOM矩陣熱圖，就是配色很奇怪。所以經(jīng)常有人詢問這個(gè)問題：

奇怪的配色

但是官網(wǎng)配色是：

WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決

官網(wǎng)配色

首先，這個(gè)差異其實(shí)并不重要，當(dāng)然了這個(gè)TOM矩陣熱圖本身就可有可無，僅僅是因?yàn)榻坛汤锾岬搅硕?，大部分情況下，就是湊圖。

再說，這個(gè)配色問題，跟WGCNA沒有關(guān)系，是R語言技巧罷了?；蛘哒f是搜索技巧：

https://www.biostars.org/p/394615/#394743

簡單的配色代碼即可解決：

TOMplot(plotTOM, geneTree, moduleColors, main = "Network heatmap plot, all genes", col=gplots::colorpanel(250,'red',"orange",'lemonchiffon'))

看完上述內(nèi)容是否對您有幫助呢？如果還想對相關(guān)知識有進(jìn)一步的了解或閱讀更多相關(guān)文章，請關(guān)注創(chuàng)新互聯(lián)行業(yè)資訊頻道，感謝您對創(chuàng)新互聯(lián)的支持。

當(dāng)前標(biāo)題：WGCNA的TOM矩陣熱圖配色問題該怎么解決
網(wǎng)頁URL：http://www.rwnh.cn/article28/peopjp.html

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