這篇文章將為大家詳細(xì)講解有關(guān)odd ratio值在關(guān)聯(lián)分析中的含義是什么，文章內(nèi)容質(zhì)量較高，因此小編分享給大家做個(gè)參考，希望大家閱讀完這篇文章后對相關(guān)知識(shí)有一定的了解。

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在GWAS分析中，利用卡方檢驗(yàn)，費(fèi)舍爾精確檢等方法，通過判斷p值是否顯著，我們可以分析snp位點(diǎn)與疾病之間是否存在關(guān)聯(lián)，然而這得到的僅僅是一個(gè)定性的結(jié)論，如果存在關(guān)聯(lián)，其關(guān)聯(lián)性究竟有多強(qiáng)呢？

很顯然，我們需要一個(gè)量化指標(biāo)來描述關(guān)聯(lián)的強(qiáng)弱程度。類似于相關(guān)性檢驗(yàn)，通過p值只能夠說明兩個(gè)變量是否相關(guān)。至于其相關(guān)性的大小，是正相關(guān)還是負(fù)相關(guān)，還需要結(jié)合相關(guān)系數(shù)來作出判斷。在關(guān)聯(lián)分析中的”相關(guān)系數(shù)”則對應(yīng)兩個(gè)常用的統(tǒng)計(jì)量， risk ratio和odd ratio。

以探究吸煙和肺癌之間的關(guān)聯(lián)為例，基于的數(shù)據(jù)格式如下

	肺癌	正常個(gè)體
吸煙	a	b
不吸煙	c	d

risk ratio， 也叫做relative risk, 簡寫為RR, 通常稱之為相對風(fēng)險(xiǎn)度，是暴露組的發(fā)病率與非暴露組的發(fā)病組的比值。對于上述數(shù)據(jù)，RR的計(jì)算過程如下

吸煙組患肺癌的比例 a / (a + b)

不吸煙組患肺癌的比例 c / (c + d)

RR  = (a / (a + b)) /( c / (c + d))

RR的數(shù)值大小直觀的反映了暴露因素中發(fā)病率的大小，RR>1, 暴露組中發(fā)病率大于非暴露組的發(fā)病率，說明暴露因素和發(fā)病率是正相關(guān)關(guān)系，反之，RR<1, 暴露組中發(fā)病率小于非暴露組的發(fā)病率，說明暴露因素和發(fā)病率是父相關(guān)關(guān)系。如果RR = 1, 兩組發(fā)病率相等，說明暴露因素和發(fā)病率沒有關(guān)聯(lián)。

值得一提的是，在計(jì)算過程中使用了抽樣數(shù)據(jù)的頻率來代表發(fā)病的概率，這個(gè)只有當(dāng)抽樣數(shù)目非常大才適用， 所以RR值適用于大規(guī)模的隊(duì)列樣本。對于常規(guī)的case/control研究，其抽樣的數(shù)目都達(dá)不到這樣的規(guī)模。所以不能直接用上述公式來計(jì)算RR，進(jìn)一步提出了odd ratio的概念。

對于罕見疾病，患病的個(gè)體數(shù)量遠(yuǎn)小于正常組的數(shù)量，出于這樣的考慮，將上述模型做一個(gè)簡化處理，a + b 的值用b里表示，c + d的值有d 來表示，因?yàn)閍遠(yuǎn)小于b, c遠(yuǎn)小于d, 幾乎可以忽略不計(jì)，此時(shí)上述公式就變成了

(a / b) /  (c / d) = (a d) /( b c)

這個(gè)公式計(jì)算出的結(jié)果就是odd ratio, 簡稱OR, 也叫做優(yōu)勢比，交叉乘積比等。從上述轉(zhuǎn)換可以看出來，OR其實(shí)是RR的一個(gè)估計(jì)值，其含義和RR值相同。
通過OR值來定量描述關(guān)聯(lián)性的大小， 使得我們可以直觀比較不同因素和疾病之間關(guān)聯(lián)性的強(qiáng)弱，有助于篩選強(qiáng)關(guān)聯(lián)的因素。

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